《两个人的小森林》是一部以清新森林为背景的浪漫爱情剧。剧情中，植物学教授庄羽一心扑在黄花蒿的培育研究上，对名利和社交毫不在意。多年前，他无意中伤害了对他有好感的乡村女孩虞美人。多年后，虞美人以鸟类学博士的身份转行成为时尚博主，却意外地与庄羽重逢。

庄羽在清水村进行野外调研时，住进了虞美人家的民宿。在虞美人的帮助下，庄羽的科研工作得以顺利进行，同时他也感受到了虞美人身上独特的爱与温情。虞美人被庄羽对学术的执着所感染，决定利用自己的知识回馈家乡。

两人在追求各自梦想的道路上相互支持，虽然起点不同，但都怀揣着建设祖国、建设家乡的共同理想。两人在森林中携手同行，谱写了一曲清新浪漫的森林恋曲。