《命运之夜——天之杯Ⅲ：春之歌》的剧情深入到了《Fate/stay night》游戏的天之杯故事线的核心。在圣杯战争中，间桐樱，一位因罪孽而陷入黑暗的少女，成为了各方争夺的焦点。卫宫士郎在知晓樱的困境后，决定不再逃避，他誓言成为樱的正义伙伴，并联手远坂凛，共同面对这场残酷的战斗。

随着故事的发展，伊莉雅丝菲尔·冯·爱因兹贝伦选择直面自己的命运，而间桐脏砚则企图利用樱来实现自己的野心。在最后的决战中，少年与少女的命运交织在一起，他们勇敢地挑战命运，试图改变自己的未来。整个剧情充满了紧张刺激的战斗场面，同时也深刻探讨了人性、正义与牺牲的主题。