《大明悬案录之隐翅篇》的剧情发生在2024年设定的古代中国京城。京城突然遭遇飞虫伤人事件，民众恐慌不已，夜间家家闭户不出。朝廷命六扇门一个月内解决此案。名捕何越非被委以重任，而正义感强烈的丁昭昭也私下调查。丁昭昭在树林探查真相时，遭遇危险，幸被楚不凡所救。

楚不凡利用人脉与何越非协商，成功让丁昭昭参与查案。三人发现道士李子风借飞虫事件牟利，十分可疑。他们变装偷走道士的解药，并在寻找医者时偶遇了与温思行相似的游医魏紫。四人组成团队深入调查，逐渐发现这背后竟是一场精心策划的复仇计划。随着调查的深入，真相逐渐浮出水面，一场关于权力、欲望和复仇的较量即将上演。