《特别行动》以1948年的香港为背景，真实再现了那段波谲云诡的历史时期。剧情中，一批以童江南教授为首的爱国民主人士，在“五一口号”的号召下，毅然决定回归解放区，投身新中国的建设。然而，他们的行动却遭到了国民党反动派的极力阻挠。

苏行，作为童江南教授的学生，接到组织的紧急任务，前往香港护送教授安全返回。他一到香港，就遭遇了重重困难，不仅负责联络的涂哲被敌人杀害，还发现了隐藏在暗处的“蜜蜂”计划。

在与国民党特务的斗智斗勇中，苏行不仅成功解救了被绑架的童教授和他的女儿，还在驶往烟台的船上制服了企图炸船的敌人。最终，他克服了重重困难，将童教授等民主人士安全地护送到了解放区，为新中国的建立贡献了自己的力量。