《美少女的谎言：原罪 第二季》的剧情在2024年的美国继续展开，承接第一季的紧张氛围。在玫瑰镇，四位少女——Spencer、Hanna、Aria和Emily的生活再次被一条神秘短信「A」搅得不得安宁。这个未知的发信人似乎掌握着她们深藏的秘密，每一次的揭露都让她们的生活陷入更深的危机。

Spencer，完美主义者，不断在学业和与姐姐的复杂关系中挣扎；Hanna，渴望出名，却不得不面对身材的困扰和「A」的威胁；Aria，逐渐融入社会，但内心的挣扎和过去的阴影仍如影随形；Emily，游泳健将，却在家人的期望和「A」的威胁间左右为难。

随着剧情的深入，四位少女不仅要面对「A」的威胁，还要揭开各自心中隐藏的秘密，以及这一切背后更深层次的阴谋。