《汉娜 第一季》的剧情围绕着少女汉娜与她的父亲埃里克展开。故事发生在靠近北极圈的冰原森林中，埃里克曾经是一名CIA特工，拥有矫健的身手和丰富的经验。在他为CIA效命期间，妻子和刚出生不久的女儿汉娜成为了秘密项目的试验品。埃里克不忍女儿受苦，偷偷潜入罗马尼亚的试验基地带着汉娜逃了出去。在躲避CIA追捕的过程中，埃里克的妻子被打死，他一人抱着女儿逃进了波兰的森林，从此隐居于此，一过就是十六年。

在这十六年里，埃里克一直对汉娜进行特种训练，希望她有能力保护自己。汉娜逐渐成长为一个顶级的杀手，甚至徒手格斗的能力都超过了埃里克，而且她天生异于常人，能提前感知到危险。然而，随着年龄的增长，汉娜对外面世界的好奇也日益增强。终于，她越过父亲划下的界限跑了出去，结识了伐木工男孩，并因此暴露了行踪。

CIA为了掩盖试验项目的秘密，对父女二人展开了追杀。汉娜为了保护父亲，机智地暴露了自己的位置，装作柔弱无助的小女孩被带回了CIA的秘密基地，故事至此达到了高潮。